Expertos de la Universidad de Barcelona, el Instituto de Qu\u00edmica Avanzada de Catalu\u00f1a (IQAC-CSIC), el Instituto de Microelectr\u00f3nica de Barcelona (IMB-CNM-CSIC) y el Instituto de Nanociencia y Materiales de Arag\u00f3n (INMA) \u2014un instituto mixto del CSIC y de la Universidad de Zaragoza (UNIZAR)\u2014 han desarrollado un nuevo m\u00e9todo para detectar virus ARN basado en la tecnolog\u00eda de uso de sondas formadoras de estructuras tr\u00edplex. Esta metodolog\u00eda innovadora abre nuevas opciones para detectar virus como el SARS-CoV-2, el virus de la gripe A (H1N1) o el virus sincitial respiratorio (VSR), un pat\u00f3geno que afecta a reci\u00e9n nacidos y que exige un cuidado diagn\u00f3stico diferencial.<\/b><\/p>\n
Este trabajo interdisciplinario, publicado en la revista\u00a0International Journal of Molecular Sciences<\/i><\/a>, est\u00e1 liderado por Carlos J. Ciudad y Ver\u00f3nica No\u00e9, de la\u00a0Facultad de Farmacia y Ciencias de la Alimentaci\u00f3n<\/a>\u00a0y del Instituto de Nanociencia y Nanotecnolog\u00eda (IN2UB<\/a>) de la Universidad de Barcelona; Ram\u00f3n Eritja, Anna Avi\u00f1\u00f3, Llu\u00efsa Vilaplana y M.Pilar Marco, del IQAC-CSIC y el CIBER de Bioingenier\u00eda, Biomateriales y Nanomedicina (CIBER-BBN); Manuel Guti\u00e9rrez, Antoni Baldi y C\u00e9sar Fern\u00e1ndez, del IMB-CNM-CSIC, y Valeria Grazu y Jes\u00fas Mart\u00ednez, investigadores del CSIC en el Instituto de Nanociencia y Materiales de Arag\u00f3n INMA (CSIC-UNIZAR) y del CIBER-BBN.<\/p>\n Este trabajo de investigaci\u00f3n se realiz\u00f3 en el contexto del proyecto PoC4CoV, liderado por M. Pilar Marco y C\u00e9sar Fern\u00e1ndez y financiando a trav\u00e9s de la Plataforma Tem\u00e1tica Interdisciplinar de Salud Global del CSIC. Posteriormente, la investigaci\u00f3n ha continuado como parte de un proyecto financiado por La Marat\u00f3 de TV3 de 2020 para luchar contra la COVID-19 en el que tambi\u00e9n participan expertos de la\u00a0Facultad de Qu\u00edmica<\/a>\u00a0de la UB.<\/p>\n Pinzas de polipurinas para capturar el ARN viral<\/b><\/p>\n La nueva metodolog\u00eda se basa en la capacidad de las pinzas de polipurinas (PPRH) \u2014dise\u00f1adas por el\u00a0grupo de terapia del c\u00e1ncer\u00a0<\/a>de la UB\u2014 para capturar el ARN viral y formar un tr\u00edplex de alta afinidad. Cuando esta estructura h\u00edbrida se conecta con una sonda molecular y se pone en contacto con la muestra del paciente afectado, se obtiene una se\u00f1al de detecci\u00f3n del agente viral. El m\u00e9todo presentado ahora en la publicaci\u00f3n cient\u00edfica se ha denominado Triplex Enhanced Nucleic Acid Detection Assay (TENADA).<\/p>\n \u00abLas PPRH son horquillas de ADN de una sola cadena no modificado que est\u00e1n formadas por dos dominios especulares de polipurinas antiparalelas. Estos dominios, conectados entre s\u00ed por un bucle de timidina, se unen por enlaces intramoleculares de Hoogsteen inversos.<\/p>\n Las pinzas moleculares pueden unirse de forma espec\u00edfica a secuencias de polipirimidinas en virus de ADN monocatenario (ADNmc), bicatenario (ADNbc) o ARN mediante enlaces de Watson-Crick, formando as\u00ed un tr\u00edplex antiparalelo\u00bb, detalla el catedr\u00e1tico Carlos J. Ciudad, del Departamento de Bioqu\u00edmica y Fisiolog\u00eda de la UB.<\/p>\n Una metodolog\u00eda efectiva y m\u00e1s r\u00e1pida que el test PCR<\/b><\/p>\n Entre las ventajas que presenta en la detecci\u00f3n del ARN v\u00edrico, cabe destacar que la metodolog\u00eda de las PPRH puede aplicarse sin la intervenci\u00f3n de la transcriptasa inversa \u2014la enzima que convierte el ARN en ADN\u2014 ni del termociclador (el aparato que amplifica las muestras material gen\u00e9tico con la reacci\u00f3n en cadena de la polimerasa o PCR). Adem\u00e1s, tiene una sensibilidad y especificidad equivalente a la de la prueba PCR y puede aportar resultados en menos de una hora.<\/p>\n En el marco del trabajo, el equipo utiliz\u00f3 el formato s\u00e1ndwich de hibridaci\u00f3n en varios dispositivos de biodetecci\u00f3n. Esta estrategia utiliza dos oligonucle\u00f3tidos: una horquilla de PPRH formadora de tr\u00edplex que act\u00faa como sonda de captura y un oligonucle\u00f3tido de ADN formador de d\u00faplex marcado que act\u00faa como sonda de detecci\u00f3n.<\/p>\n \u00abLas horquillas de PPRH que forman tr\u00edplex se dise\u00f1aron para unirse a secuencias de polipirimidina del SARS-CoV-2, mientras que las sondas de detecci\u00f3n se dise\u00f1aron como complementarias de una regi\u00f3n cercana al lugar de la diana de las polipirimidinas. As\u00ed, la presencia del ARN del SARS-CoV-2 se detecta mediante la formaci\u00f3n del complejo ternario en la superficie del biosensor\u00bb, detalla la catedr\u00e1tica Ver\u00f3nica No\u00e9 (UB-IN2UB).<\/p>\n Esta metodolog\u00eda se ha implementado en un dispositivo electroqu\u00edmico compacto que integra una celda electroqu\u00edmica de dos electrodos en un chip \u2014fabricada en la Sala Blanca de Micro y Nanofabricaci\u00f3n del IMB-CNM-CSIC\u2014 y un componente flu\u00eddico en papel, y en un sistema de flujo lateral t\u00e9rmico implementado en nitrocelulosa y utilizando nanopart\u00edculas plasm\u00f3nicas y papel t\u00e9rmico que se ha desarrollado en el INMA (CSIC-UNIZAR).<\/p>\n TENADA: aplicaciones en investigaci\u00f3n biom\u00e9dica<\/b><\/p>\n Las PPRH est\u00e1n descritas en la bibliograf\u00eda cient\u00edfica como herramientas de silenciamiento g\u00e9nico de diversos genes implicados principalmente en el c\u00e1ncer. Adem\u00e1s, tambi\u00e9n se han incorporado como sondas en biosensores para la detecci\u00f3n de peque\u00f1as mol\u00e9culas de ARN (micro-ARN) para determinar el estado de metilaci\u00f3n del ADN y para el diagn\u00f3stico de neumon\u00eda causada por el hongo\u00a0Pneumocystis jirovecii.<\/i><\/p>\n Ahora, la nueva metodolog\u00eda TENADA se revela eficaz no s\u00f3lo en la detecci\u00f3n de part\u00edculas virales. La alta afinidad de las PPRH por el ARN viral es una propiedad que puede aplicarse para inhibir el proceso de replicaci\u00f3n del virus. Por este motivo, ahora tambi\u00e9n son objeto de estudio las propiedades antivirales de las pinzas de polipurinas CC1PPRH y CC2PPRH en c\u00e9lulas del linaje VeroE6 infectadas con viriones SARS-CoV-2.<\/p>\n En paralelo, el trabajo de los distintos grupos implicados tambi\u00e9n ha sido la base de una tecnolog\u00eda que se patent\u00f3 y licenci\u00f3 en julio de 2022 mediante la participaci\u00f3n del\u00a0Centro de Patentes<\/a>\u00a0de la UB, el CSIC y el CIBER-BBN. A su vez, esta patente ha sido licenciada de manera no exclusiva a la empresa espa\u00f1ola Nanoinmunotech a trav\u00e9s de la gesti\u00f3n de la Fundaci\u00f3n Bosch i Gimpera (FBG-UB<\/a>) en el proceso de protecci\u00f3n de la tecnolog\u00eda y el acuerdo de licencia de la empresa.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Expertos de la Universidad de Barcelona, el Instituto de Qu\u00edmica Avanzada de Catalu\u00f1a (IQAC-CSIC), el Instituto de Microelectr\u00f3nica de Barcelona…<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":15691,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"inline_featured_image":false,"_monsterinsights_skip_tracking":false,"_monsterinsights_sitenote_active":false,"_monsterinsights_sitenote_note":"","_monsterinsights_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[3],"tags":[],"class_list":["post-15692","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-actualidad"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.fbg.ub.edu\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/15692","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.fbg.ub.edu\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.fbg.ub.edu\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.fbg.ub.edu\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.fbg.ub.edu\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=15692"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.fbg.ub.edu\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/15692\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":15693,"href":"https:\/\/www.fbg.ub.edu\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/15692\/revisions\/15693"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.fbg.ub.edu\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/15691"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.fbg.ub.edu\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=15692"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.fbg.ub.edu\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=15692"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.fbg.ub.edu\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=15692"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}